Vėžio „pasaulinis žiniatinklis“

Jau keletą metų gydytojai ir kompiuterių mokslininkai JAV ir užsienyje bandė pagerinti vėžio priežiūrą – nuo ​​diagnozės iki gydymo – kurdami plačias, tarpusavyje susijusias duomenų bazes, pilnas informacijos apie pacientus. Jie vadina šias saugyklas medicininiais tinkleliais ir įsivaizduoja dieną, kai Strasbūro ar Naujojo Delio gydytojas galės pamatyti, pavyzdžiui, kad nesuprantamas paciento plaučių vaizdas yra labai panašus į San Francisko paciento, kurio ligos istorija galėtų padėti apsispręsti. atlikti biopsiją.

Šiose kuriamose duomenų bazėse yra ne tik pacientų ligos istorijos, įskaitant tokius duomenis kaip MRT ir kompiuterinės tomografijos tyrimai, bet ir informacija apie tai, kaip jie reagavo į vaistus. Tačiau šių statomų tinklų pranašumai buvo lėtai, iš dalies dėl techninių problemų ir iš dalies dėl to, kad dėl federalinių privatumo taisyklių sunku dalytis duomenimis. Dabar Nacionalinio vėžio instituto projektas galėtų išbandyti kelių ligoninių sistemą, skirtą plaučių vėžio vaizdams palyginti jau šiais metais – tai aiškus žingsnis link tinklelių naudojimo.

Ši istorija buvo mūsų 2006 m. kovo mėnesio numerio dalis

• Žr. likusią numerio dalį
• Prenumeruoti

Kennethas H. Buetowas, instituto Bioinformatikos centro Bethesdoje, MD, direktorius, vadina tai esminiu pirmuoju žingsniu link pasaulinio vėžio tyrimų tinklo.

Per pastaruosius metus Buetow ir jo komanda surinko daugiau nei 50 000 plaučių vėžio vaizdų, gautų atliekant medicininius tyrimus, ir suarchyvavo juos saugioje elektroninėje NCI saugykloje. Jų pastangos yra trejus metus trunkančio 60 mln. USD bandomojo projekto, pradėto 2004 m., dalis, kuriame dalyvauja 50 vėžio centrų ir daugiau nei 600 tyrėjų. Archyvas dabar pasiekiamas internete adresu http://ncia.nci.nih.gov . Be kitų vaizdo gavimo projektų, jame yra daugybė plaučių vėžio atvejų, stebimų gydymo metu.

Kadangi duomenų bazė dabar beveik sukurta, bandymai neišvengiami. Vaizdų kolekcija yra skirta paskatinti ir palengvinti naujos programinės įrangos, kuri gali automatiškai palyginti plaučių vaizdus su duomenų bazėje esančiais vaizdais, tyrimus. Tokioje programinėje įrangoje algoritmai ieškos bendrų dalykų ir sukurs tikėtinų atitikčių katalogą. Biurų ir ligoninių gydytojai galės palyginti gautus plaučių vaizdus su nuskaitymais, kuriuos jiems reikia įvertinti.

Vaizdų palyginimas yra tik pirmas žingsnis. Jei viskas klostysis gerai, per trejus metus Nacionalinis vėžio institutas tikisi atlikti vieną ar kelis klinikinius tyrimus, kurių metu bus gauta daugybė medicininių duomenų apie plaučių vėžį, įskaitant vaizdus, ​​navikų tipus, vaistų vartojimo kursus, pacientų rezultatus ir net plaučių vėžio molekulinius profilius. liga – naudotų gydytojai, tiriantys konkrečius atvejus. Šių atvejų rezultatai būtų lyginami su atvejų, gydomų įprastiniais vėžio diagnostikos metodais, rezultatais. Toks palyginimas turėtų suteikti informacijos ne tik apie pacientų medicininį atsaką, bet ir apie tai, kaip tiksliai gydytojai nustatė diagnozes ir netgi apie tai, kiek jie laikėsi medicininio privatumo standartų.

Medicinos tinklo tyrinėtojams netrūksta regėjimo. Vaizdų palyginimas yra tik pirmas žingsnis. Tais atvejais, kai skenavimas sutampa, gydytojai tikisi, kad galės giliau įsigilinti į panašių atvejų istorijas ir sužinoti, kurie vaistai ar operacijos veikė geriausiai. Ir Buetow sako, kad jo bandymai iš tikrųjų galėtų paspartinti dieną, kai kai kurios vėžio diagnozės bus automatizuotos. Gydytojas galėtų įvesti vaizdus (o plečiantis tinkleliui, kraujo tyrimų rezultatus, genetinių žymenų aprašymus ir kitus pacientų duomenis) ir sužinoti, kaip dažnai beveik identiški pacientų visame pasaulyje tyrimų rezultatai koreliuoja su specifiniais piktybiniais navikais, tokiais kaip limfomos, melanomos, arba sarkomos.

Ir ateityje, sumažėjus genų sekos nustatymo išlaidoms, NCI tinklelis netgi gali apimti pacientų genominę informaciją. Tinklo galia yra gebėjimas kaupti ir susieti vis daugiau visuomenės sveikatos duomenų iš viso pasaulio, sakė Mary Kratz iš Mičigano universiteto medicinos mokyklos, tinklo tyrimų bendruomenės techninės patarėjos. Kuo daugiau duomenų turite, tuo daugiau žinių generuosite.

Tuo tarpu reikia išspręsti kasdienes technines problemas.

Kadangi duomenys, pateikiami kartu su vaizdais, įvairiose ligoninėse skiriasi pagal tipą ir formatą, mokslininkai kuria standartinius formatus, kurie gali juos visus suderinti. Mes prašome daugelio konkurencingų institucijų mokslininkų panaikinti kliūtis dalytis didžiuliu duomenų kiekiu, sako Howardas Bilofsky, Pensilvanijos universiteto Bioinformatikos centro, dalyvaujančio NCI projekte, vyresnysis bendradarbis. Galimybė dalytis informacija tinkleliuose visame pasaulyje gyvosios gamtos mokslų tyrimų arenoje nėra toks dalykas, kurį lengva padaryti.

paslėpti