211service.com
Vėžio atlasas, numatantis, kaip seksis pacientams
Supratimas apie genetinius navikų pokyčius, išskiriančius mirtingiausius vėžius nuo gerybinių, galėtų padėti gydytojams geriau gydyti pacientus.
Šiandien Švedijos mokslininkai pradeda naują atviros prieigos katalogas kuri parodo daugelį tų genetinių pokyčių. Šis atlasas susieja tūkstančius specifinių genų, susijusių su daugybe vėžio formų, su paciento išgyvenimu, taip pat atskleidžia galimus naujus vaistų taikinius.
Naujasis atlasas yra vienas iš kelių nuolatinių pastangų suprasti duomenis, surinktus viešosiose duomenų bazėse, pvz., Nacionalinio vėžio instituto vėžio genomo atlase, kurie veikia kaip navikų mėginių saugyklos. Tikslas yra surinkti praktinę informaciją, pavyzdžiui, ligos žymenis, kurie gali būti naudojami kuriant vaistus nuo vėžio ir diagnostiką.
Norėdami sukurti atlasą, tyrėjai, vadovaujami Švedijos Karališkojo technologijos instituto mikrobiologijos profesoriaus Mathiaso Uhléno, panaudojo superkompiuterį, kad iš beveik 8000 navikų mėginių analizuotų 17 pagrindinių žmogaus vėžio tipų. Uhlénas sako, kad jo komanda ieškojo holistinių pokyčių visame genome, kurį sukelia šios mutacijos.
Tada jie surašė visus genus, esančius tose vėžio ląstelėse, kad išsiaiškintų, kaip šių genų pagaminti baltymai veikia paciento išgyvenimą. Genai turi nurodymus, kaip gaminti baltymus, o genų ekspresijos lygis padidina arba sumažina baltymų, kuriuos gamina genai, kiekį. Šie gauti baltymai gali smarkiai paveikti biologinius procesus, tokius kaip vėžys.
Tyrėjai pastebėjo, kad skirtingų vėžio formų baltymų kiekis labai skyrėsi, o tai sustiprina individualizuoto vėžio gydymo poreikį, pagrįstą unikaliomis paciento naviko savybėmis.
Tyrėjai nustatė, kad daugiau nei 2000 genų turėjo skirtingą poveikį paciento išgyvenamumui, priklausomai nuo vėžio tipo ir naviko buvimo vietos kūne. Kai kuriais atvejais labiau išreikšti genai buvo susiję su geresniais pacientų rezultatais, o kiti numatė blogesnes pacientų perspektyvas. Rezultatai yra išsamūs šiandien žurnale Mokslas .
Uhlénas ir jo komanda nustatė dar vieną daugiau nei 2000 genų rinkinį, galintį sunaikinti naviko augimą, tačiau teigia, kad daugelio šių taikinių poveikis vaistais gali turėti rimtų šalutinių poveikių pacientams. Jie prognozuoja, kad 32 genai, rasti daugiau nei 80 procentų navikų, neatsižvelgiant į vėžio tipą, yra narkotikų taikiniai.
Anksčiau mokslininkai daugiausia dėmesio skyrė DNR sekos nustatymui, kad nustatytų genetines mutacijas, susijusias su vėžiu. Norėdami sukurti šį naują atlasą, mokslininkai naudojo RNR sekos nustatymą, kad suprastų, kaip keičiasi genai, kai juos paveikė vėžys.
Genų sekos nustatymo bendrovės „Illumina“ onkologijos viceprezidentas Johnas Leite'as teigia, kad norint suprasti pagrindinius vėžio formavimosi mechanizmus ir galiausiai tyrėjams bei gydytojams numatyti geriausias pacientų gydymo galimybes, reikės daug biologinės informacijos. Štai kur šis naujas atlasas galėtų padėti.
Niujorko genomo centro skaičiavimo biologijos direktoriaus padėjėjas Nicolas Robine'as sako, kad atlasas bus naudingas šaltinis tyrėjams, tačiau teigė, kad jis negali pateikti galutinio automatinio atsakymo gydytojams, besidominantiems paciento vėžio progresavimu. Tai nėra taip, kad prijungiate savo išraiškos profilį ir jums pasakys, ar jūsų rezultatas geresnis, ar blogesnis.
Atlasas yra Švedijos programos, pradėtos 2003 m., dalis, kuria siekiama nustatyti visus žmogaus baltymus, pagamintus iš maždaug 20 000 ar daugiau organizmo genų.