211service.com
Prasideda didžiulė autizmo genų paieška
Autizmo genetinio pagrindo medžioklė netrukus gali priartėti prie sunkiai suprantamo tikslo. 11 Bostono srities institucijų, įskaitant MIT ir Broad Institute, mokslininkai naudos naujas priemones, kad analizuotų DNR mėginius iš tūkstančių autistų ir jų šeimų. Tikimasi, kad tai bus didžiausia iki šiol genetinių autizmo priežasčių paieška ir gali duoti kandidatų genus vos per šešis mėnesius.
Genetinių variacijų, didinančių autizmo riziką, nustatymas gali paskatinti naujus šio sutrikimo gydymo būdus. (Kreditas: Istockphoto.com/mevans)
Šis projektas leis mums tyrinėti genomą su precedento neturinčiu detalumu, sako Markas Daly, tyrėjas Platus institutas kas dalyvauja projekte. Kai suprasime genus ir ligos priežastinius kelius, galime sutelkti dėmesį į šių genų terapijos tyrimus ir plėtrą.
Mokslininkai žino, kad autizmas, kuris pasireiškia maždaug vienam iš 166 vaikų, turi genetinį komponentą; autistiškų žmonių broliai ir seserys turi daug didesnę tikimybę susirgti šia liga nei visa populiacija. Tačiau liga tikriausiai turi daugybę priežasčių, įskaitant aplinkos poveikį ir daugybę genų. Kaip ir kitų sudėtingų genetinių ligų atveju, nustatyti genus, kurie padidina riziką, buvo nepaprastai sunku.
Ankstesni tyrimai nustatė didelius genomo regionus, kuriuose, atrodo, yra genetinių variacijų, susijusių su autizmu. Tačiau tame regione gali būti šimtai genų, o dėl DNR analizės technologijos ribų konkretaus kaltininko nustatymas tapo iššūkiu. Tokiose situacijose mokslininkai dažniausiai spėja remdamiesi žinoma ligos biologija. Tai labai apmaudu, sako Rudy Tanzi , Harvardo medicinos mokyklos neurologė ir projekto bendradarbė. Maža tikimybė, kad pasirinkote tinkamą geną.
Tačiau dabar mokslininkai gali daug nuodugniau nuskaityti genomą, naudodami naujesnes genų lustų atmainas, mažytes stiklines plokšteles, padengtas tam tikromis DNR sekomis, kurios gali nustatyti sekas mėginyje, prisijungdamos prie jų. Naujausi lustai gali greitai aptikti daugiau DNR sekų nei bet kada anksčiau – šimtus tūkstančių jų vienu metu. Dabar tarp stiklų galime rasti deimantų, sako Tanzi.
Naujajame tyrime bus naudojamas lustas, kurį sukūrė Affymetrix , DNR analizės įmonė, įsikūrusi Santa Klaroje, Kalifornijoje, viename eksperimente ieškanti 500 000 specifinių genetinių variacijų arba SNP (vieno nukleotido polimorfizmų). Mokslininkai išanalizuos 3700 autizmo žmonių ir jų šeimų DNR, kad nustatytų SNP, kurie dažniau atsiranda tiems, kurie turi sutrikimą, palyginti su nepaveiktais tyrimo dalyviais.
Kadangi lustas aptinka tiek daug SNP, beveik kiekvieną iš jų galima atsekti iki vietos, esančios šalia konkretaus genomo geno arba jo viduje. Tanzi sako, kad kiekvienas smūgis gali nukreipti jus į dominantį geną. Tai tikrai didžiulis šuolis į priekį, tarsi perėjimas iš Mažosios lygos į pagrindines lygas.
Kai tik tyrėjai suras kandidatų genų sąrašą, kuris, jų manymu, gali įvykti vos per šešis mėnesius, jie paskelbs duomenis viešai, kad kiti mokslininkai galėtų ištirti genus ir jų vaidmenį sergant autizmu. Ekspertai tikisi, kad projektas nukreips į genus ir kelius, apie kuriuos niekas niekada negalvojo apie autizmą – kelius, kurie iš tikrųjų gali būti sutrikimo priežastis.
Iš tiesų, tyrimai, naudojant pažangias DNR lustus, atskleidė nuostabias kitų ligų priežastis. Pasak Daly, panašus su amžiumi susijusios geltonosios dėmės degeneracijos (pagrindinė vyresnių nei 55 metų žmonių aklumo priežastis Jungtinėse Amerikos Valstijose) tyrimas išryškino genus, dalyvaujančius imuninės sistemos veikloje, o ne genus, būdingus akims ar smegenims. Genetika atvedė mus į biologinį kelią, į kurį žmonės nebuvo susikoncentravę, sako Daly. Tai suteikia pagrindą, leidžiantį mokslinių tyrimų bendruomenei sutelkti dėmesį į tai, kas iš tikrųjų yra priežastinis ryšys, o ne tik į ligos poveikį.
Kiti planuojami arba vykdomi tyrimai, kuriuose naudojamas naujasis Affymetrix lustas, kuris rinkoje pasirodė praėjusį rugsėjį, yra skirtas sutrikimams, įskaitant diabetą, nutukimą ir Alzheimerio ligą. Tanzi jau atliko pradinę Alzheimerio liga sergančių pacientų analizę ir tikisi, kad per mėnesį bus pateiktas kandidatų genų sąrašas.
Taigi ar šios genų lustai pagaliau privers sudėtingas genetines ligas pasiduoti DNR analizei? Esu labai įsitikinęs, kad rasime genų, susijusių su sudėtingais sutrikimais, sako Daly. Esu vienodai įsitikinęs, kad nerasime visų, o gal net ne daugumos. Tačiau dėl neuropsichiatrinių sutrikimų, tokių kaip autizmas ar šizofrenija, kai mes nežinome nė vieno iš genų arba neturime jokio supratimo apie sutrikimo priežastinį pagrindą, net vieno geno atskleidimas gali būti transformuotas.
Tiems, kurie kasdien susiduria su tokios ligos, kaip autizmas, paslaptimis, tai yra sveikintina naujiena. Tai tikrai pažangiausios technologijos, sako Andy Shih, Niujorke įsikūrusios advokatų grupės „Autism Speaks“ vyriausiasis mokslo darbuotojas. Įdomu tai, kad žmonės nori pritaikyti šią technologiją autizmui.