211service.com
„Pacific Biosciences“ sekos nustatymo mašina buvo pristatyta
Pacific Biosciences labai lauktas naujas sekos aparatas pagaliau atvyko.
Bendrovė pristatė instrumentą renginio dalyviams Genomo biologijos ir technologijų pažangos susitikimas , prašmatnus įvykis, kuris tapo ta vieta, kur galima pasižymėti seka. Iki šiol turėdama 266 mln. USD rizikos finansavimą ir unikalią technologiją, galinčią realiu laiku nuskaityti atskiras DNR molekules, „Pacific Biosciences“ nuo tada buvo daugiausiai diskusijų apie sekos nustatymą. pirmą kartą atsirado iš slapto režimo toje pačioje konferencijoje 2008 m. Iš tiesų, „Pacific Biosciences“ buvo įtraukta į mūsų TR50, 50 novatoriškiausių įmonių sąrašą.
Bendrovė taip pat paskelbė, kad jau pardavė dešimt vienetų, kurių kiekvieno kaina yra 695 000 USD, su daugybe sekos centrų, laukiančių sparnuose. (Į pirmąjį klientų ratą įtraukta: Baylor medicinos koledžas, Broad Institute, Cold Spring Harbor laboratorija, JAV Energetikos departamentas Jungtinis genomo institutas, Vašingtono universiteto Genomo centras, Monsanto, Nacionalinis vėžio institutas / SAIC-Frederick , Nacionalinis genomo išteklių centras, Ontarijo vėžio tyrimų institutas ir Stanfordo universitetas.)
Būtent 2008 m. konferencijoje bendrovės įkūrėjas Stephenas Turneris pirmą kartą pareiškė savo dažnai kartojamą pretenziją dėl instrumento, galinčio vos per 15 minučių nustatyti žmogaus genomo seką. Pasak a peržiūra „Bio-ITWorld.com“ generalinis direktorius Hugh Martin atnaujino šią prognozę:
Net ir su būsimais atnaujinimais, Martinas sako, kad dabartinė mašina nebus ta, kuri užtikrins „15 minučių genomą“, kaip prieš dvejus metus teigė „PacBio“ įkūrėjas Stephenas Turneris. Nors laikui bėgant ZMW skaičius SMRT ląstelėje padvigubės iki 160 000 ZMW, genomui gauti PacBio reikės 1 mln. Tai tikriausiai [gali pristatyti] 2 ar 3 valandų genomą. V2 instrumentas pasieks 15 minučių tikslą, tačiau tai planuojama išleisti tik 2014 m.
Bio-IT kūrinys taip pat pažymi tai
Martinas neperžiūrėjo pėdsakų duomenų ir neaptarė klaidų dažnio mašinos peržiūroje. Tačiau vėliau šiais metais visiškai išleidžiant, jis teigė, kad vidutinis skaitymo ilgis bus 1000–1250 bazių, šiek tiek ilgesnis nei 454 arba Sangerio seka, o 5% skaitymų yra tarp 3–5 kb. Vykdydami tikslinį sekos nustatymo eksperimentą gausite 5 % iš 30 % [Puasono riba] iš 80 000 [ZMW], taigi už 99 USD gausite 1 000 nuskaitymų 3–5 kb diapazone. Nepaisant mažesnio pralaidumo, palyginti su aukščiausios klasės antrosios kartos aparatais, Martin atkreipė dėmesį į lankstumo pranašumą, pvz., leidžia paleisti diagnostinius mėginius nelaukiant, kol bus pakankamai mėginių, verta paleisti antrosios kartos dėžutę. .
Ne visi liko sužavėti. Genetikas ir tinklaraštininkas Danielis MacArthuras pažymėjo a naujausias įrašas ,
Apskritai negaliu likti priblokštas dėl visko, ką iki šiol mačiau iš „PacBio“, ypač palyginus su smarkiai pertekliniais teiginiais (15 minučių genomas, kas nors?), kuriais įmonė išgarsėjo per pastaruosius porą metų. .