Duomenų gavybos viduramžių tekstas atskleidžia mediciniškai biologiškai aktyvius ingredientus

The Lylye iš Medicynes yra XV amžiaus rankraštis, saugomas Bodleian bibliotekoje Oksforde, Anglijoje. Tai ankstesnio lotyniško traktato apie ligas vertimas į vidurinę anglų kalbą, kuriame pateikiami atvejų tyrimai ir gydymo receptai. Tai buvo įtakingas tekstas, kuris, kaip manoma, iš pradžių priklausė Robertui Broke'ui, asmeniniam Anglijos monarcho Henriko VI vaistininkui.

The Lylye iš Medicynes yra labai gerai pažįstamas istorikams, tyrinėjantiems viduramžių medicinos gydymą. Jie jau seniai žinojo, kad kai kuriuose receptuose yra ingredientų, pavyzdžiui, medaus, turinčių antibiotikų savybių.

Tačiau platesnį viduramžių medicinos veiksmingumo klausimą apskritai yra daug sunkiau ištirti. Viduramžių Europos gydytojų ir pasauliečių naudojama farmakopėja dažniausiai buvo atmesta kaip placebas ar prietaras, sako Erin Connelly iš Pensilvanijos universiteto ir kolegos iš Warwick universiteto JK.

Dabar atrodo, kad šis vaizdas pasikeis. Connelly ir kompanija teigia, kad viduramžių receptai laikėsi racionalaus gydymo modelio, kuris atlaiko šiuolaikinę mediciną. Jų įrodymai gaunami gavus duomenis apie sudedamųjų dalių modelius Lylye of Medicynes, kuri atskleidžia medžiagų tinklus receptuose, turinčius reikšmingų bioaktyvių savybių.

Pirma, šiek tiek fono. The Lylye iš Medicynes Jame yra 360 receptų, kurių kiekvienas yra standartinio formato, pradedant nuo priemonės rūšimi (pavyzdžiui, tepalo sirupu ar pleistru), tada nurodoma ligos fazė, kada ją reikia tepti, ir baigiasi ingredientų sąrašu.

Šio teksto duomenų gavyba nėra lengva užduotis. Receptuose minima daugiau nei 3000 ingredientų, skirtų 113 skirtingų būklių gydymui. 30 iš šių būklių apibūdina tokius simptomus kaip odos lūžinėjimas, pūlingas, paraudimas, juoda pluta, nemalonus kvapas, karštis ar deginimas ir pan., kurie virsta išorinių infekcijų simptomais.

Vienas iš iššūkių yra tas, kad tekste dažnai nurodomi tie patys ingredientai, naudojant skirtingus žodžius ir rašybą. Pavyzdžiui, pankolių žolė vadinama pankoliu, feniculi, feniculum, marathri, maratri ir maratrum. Visi jie turi būti sutrumpinti po ta pačia antrašte.

Tačiau įvairiose augalo dalyse gali būti skirtingų veikliųjų medžiagų, ir į tai taip pat reikia atsižvelgti. Taigi pankolio šaknis, pankolių sultis ir pankolio sėklas reikia įtraukti atskirai. Komanda taip pat ranka taisė rašybos variantus.

Standartizavusi sudedamąsias dalis, komanda ištyrė sukurtus tinklus. Tam jie sukūrė kiekvieno ingrediento mazgą ir nubrėžė ryšius tarp jų, jei jie buvo tame pačiame recepte. Kuo dažniau šie ingredientai pasirodydavo kartu, tuo šis ryšys stiprėjo. Surinkę tinklą, mokslininkai naudojo standartinį algoritmą, kad ieškotų bendruomenių tinkle.

Išvados leidžia įdomiai skaityti. Rezultatai aiškiai rodo, kad receptuose egzistuoja hierarchinė struktūra, teigia mokslininkai.

Kiekviena tinklo bendruomenė susideda iš mažesnių bendruomenių, kurios visos turi bendrą sudedamųjų dalių branduolį. Pavyzdžiui, vieną sudedamųjų dalių branduolį sudaro alavijas ir sarcolla nutria – derva iš vieno iš kelių persų medžių, sumaišytų su motinos pienu.

Keletas atskirų ingredientų tinkle atlieka svarbų vaidmenį. Tai medus, actas ir granatų žiedai.

Kitas komandos žingsnis buvo ieškoti simbolinių receptų, kuriuose būtų naudojami ingredientų deriniai. Tada jie ieškojo šiuolaikinės medicinos literatūros įrodymų, kad tie receptai galėjo būti naudingi.

Pavyzdžiui, vienas iš traktato receptų yra burnos skalavimo skystis, apibūdinamas kaip pustulių, opų, apostemų (patinimas / uždegimas), vėžio, fistulės, pūslelinės (gangrenos) ir karbunkulio (karbunkulo, pūlingo virimo) gydymas.

Šis mišinys gaminamas iš žagrenių, galų, psidijų (granato žievės arba medžio žievės), balaustijos, mastikos (iš mastikos medžio išsiskiriančios dervos, Pistacijos lentiscus ), olibanas, medus ir vynmedis tikriausiai sumaišyti su nitritu arba motinos pienu.

Svarbus klausimas yra tai, ar kuri nors iš šių ingredientų turi antibakterinį ar imunomoduliuojantį poveikį. Norėdami tai išsiaiškinti, Connelly ir jos kolegos juos ieškojo Cochrane sisteminių apžvalgų duomenų bazėje, gerai žinomoje įrodymais pagrįstų medicininių tyrimų bibliotekoje.

Pasirodo, yra gerų įrodymų, kad kai kurios iš šių sudedamųjų dalių yra biologiškai aktyvios. Žinoma, kad medus turi antibiotinių savybių, o JK nacionalinė sveikatos tarnyba jį reguliariai naudoja žaizdoms gydyti. Actas yra gera dezinfekavimo priemonė, o motinos piene yra įvairių antimikrobinių komponentų. Tulžis (arba tulžis) taip pat pripažįstama kaip stiprus baktericidas.

Tačiau yra nedaug įrodymų, kad alavijas, smilkalai, mastika ir sarkokola turi gydomąjį poveikį. Pavyzdžiui, Cochrane apžvalga apie alavijo žaizdų gijimą parodė, kad atitinkami tyrimai paprastai buvo prastos kokybės. Taigi žiuri vis dar nesutaria dėl tų medžiagų galios.

Nepaisant to, neabejotinai prasminga sujungti nurodytas sudedamąsias dalis viename burnos skalavimo skystyje. Tai padidina perteklių (jei vienas ingredientas neveikia, gali veikti kitas) ir gali padidinti veiksmingumą prieš tam tikras tikslines mikrobų rūšis, tuo pačiu metu atakuodamas kelis ląstelių taikinius arba leisdamas chemiškai aktyvuoti tam tikras komponentų molekules, tarkime Connelly ir bendradarbiai. .

Jie daro išvadą, kad burnos skalavimo skysčio receptas ir kiti panašūs į jį atspindi racionalų požiūrį į medicininių sprendimų priėmimą.

Tai įdomus darbas. Tai reiškia, kad įprastą viduramžių medicinos požiūrį kaip tik į hocus pocus reikia permąstyti. Šis darbas parodo galimybę naudoti sudėtingų tinklų algoritmus, kad būtų galima ištirti viduramžių medicininių duomenų rinkinį, skirtą pagrindinių sudedamųjų dalių derinių, susijusių su infekcinių ligų gydymu, modeliams, teigia mokslininkai.

Be to, jie mano, kad viduramžių tekstuose galima atrasti daug daugiau, įskaitant naujų antimikrobinių medžiagų, kurios šiuolaikiniam mokslui dar nežinomos, galimybę. Skaitmeninių technologijų naudojimas paverčiant šiuos tekstus duomenų bazėmis, pritaikytomis kiekybiniam duomenų gavybai, reikalauja kruopštaus tarpdisciplininio požiūrio, tačiau tai galėtų suteikti visiškai naują viduramžių mokslo ir racionalumo perspektyvą, sako Connelly ir kt.

Nuoroda: https://arxiv.org/abs/1807.07127 : Viduramžių medicininio teksto duomenų gavyba atskleidžia sudedamųjų dalių pasirinkimo modelius, atspindinčius biologinį aktyvumą prieš konkrečių infekcijų sukėlėjus

paslėpti