CDC 1,75 milijardo dolerių sekos bumas gali išmesti pinigus netinkamai problemai spręsti

Ponia Tech | Getty, Envato

• Kongresas siurbia lėšas CDC, valstijos ir vietinei genomo priežiūrai
• Kai kurios valstybės pasiekia tikslą ištirti 5 % teigiamų naujų variantų testų
• Tačiau dauguma naudos bus ilgalaikės, o dėl JAV sveikatos priežiūros taisyklių paciento stebėjimas beveik neįmanomas

Netrukus po to, kai prezidentas Bidenas buvo inauguruotas, vyras, kuriam buvo pavesta atsakyti į koronavirusą, gavo žinią apie tai, ką Amerika turi padaryti. Mes esame 43-i pasaulyje pagal genomo sekos nustatymą, sakė Jeffas Zientsas spaudos konferencijoje sausio mėn . Visiškai nepriimtina.

Atsakymas, pasak jo, buvo atlikti atitinkamą genomo sekos nustatymą, kuris leis mums anksti pastebėti variantus, o tai yra geriausias būdas susidoroti su bet kokiais galimais variantais.

Mokslininkai nustatė COVID mėginių genomų seką nuo pat pirmojo atvejo Uhane; pirmosios mRNR vakcinos buvo sukurtos naudojant genetinį kodą, kurį sausį viešai paskelbė Kinijos mokslininkai. Ir tai buvo padaryta neregėtu mastu. Gruodžio viduryje, 51 000 Covid genomų iš JAV jau buvo iškoduotas ir paskelbtas viešosiose saugyklose. Tai septynis kartus daugiau nei kasmet Ligų kontrolės ir prevencijos centrų paimamų gripo mėginių skaičius.

Didžioji dalis COVID sekos nustatymo Amerikoje buvo atliekama akademiniuose centruose. Taip yra daugiausia todėl, kad iki šiol tai buvo laikoma akademiniu užsiėmimu, stebint viruso pokyčius, kurie, kaip manoma, vystosi lėtai ir stabiliai.

Susijusi istorija

Kas nutiko Amerikos 44 milijonų dolerių vertės vakcinų duomenų sistemai? CDC užsakė programinę įrangą, skirtą vakcinos diegimui valdyti. Vietoj to, jį kankino problemos ir dauguma valstybių jį apleido.

Net lapkritį ir gruodį, nes tiek JK, tiek pietų Afrika paskelbė apie daugiau užkrečiamųjų padermių ir Danija pranešė, kad nužudys 15 milijonų audinių Siekiant užkirsti kelią mutacijai, daugelis mokslininkų ir visuomenės sveikatos organizacijų teigė, kad virusas greičiausiai neišvengs vakcinos sukelto imuniteto.

Vis dėlto, kaip perspėjo antraštės mutantinis koronavirusas plinta nekontroliuojamas , politikai ir visuomenė pareikalavo sužinoti, ar jų pačių kiemuose nėra susirūpinimą keliančių variantų.

Atsižvelgiant į nedidelę JAV infekcijų, kurios buvo sekvenuotos, dalį, variantas jau gali būti Jungtinėse Valstijose, bet nebuvo aptiktas, CDC atsakė pareiškime. paskelbta internete .

Amerika skraido aklai greitai tapo refrenu ne tik mokslininkams, ieškantiems paramos savo darbui, bet ir JAV atsako kritikams, ieškantiems išsprendžiamos problemos. Tam tikrą nusivylimą neabejotinai sukėlė netikslūs pranešimai: pavyzdžiui, gruodžio 22 d. pranešė „New York Times“. kad mažiau nei 40 Covid genomų JAV buvo sekvenuotos nuo gruodžio 1 d. Iš tikrųjų JAV laboratorijos per tą laikotarpį viešosioms saugykloms pateikė beveik 10 000 naujų sekų.

Finansinė ir politinė parama greitai sulaukė naujos administracijos su CDC 200 milijonų dolerių įmoka už sekvenavimo darbus. Tada kovo mėnesį priimtame pagalbos įstatymo projekte buvo skirta įspūdinga 1,75 mlrd.

CDC ir PSO užsibrėžė tikslą nustatyti 5% teigiamų Covid atvejų seką, kad būtų galima stebėti varianto plitimą. JAV greitai pasiekė šį tikslą, daugiausia sumokėdamos privačioms bandymų laboratorijoms, kad būtų nustatytas nedidelis skaičius teigiamų mėginių.

CDC ir PSO nustatė tikslą 5% teigiamų atvejų sekti varianto plitimą – skaičius, pagrįstas dominuojančios Covid sekvencerių gamintojos „Illumina“ atliktu tyrimu prieš spausdinimą.

JAV greitai pasiekė šį tikslą, daugiausia sumokėdamos privačioms bandymų laboratorijoms, kad būtų nustatytas nedidelis skaičius teigiamų mėginių. Paskutinę kovo savaitę, kai buvo pranešta apie 450 000 naujų atvejų, JAV laboratorijos, įskaitant akademines laboratorijas, finansuojamas pagal kitas programas, pateikė 16 143 anonimiškas sekas GISAID, pasaulinei biologinių duomenų saugyklai, ir 6 811 seką Nacionaliniam biotechnologijų informacijos centrui. arba NCBI.

(Tačiau tuo laikotarpiu atvejų skaičius buvo vienas mažiausių per šešis mėnesius; kad būtų galima sekti 5 % per sausio piką, JAV laboratorijoms būtų reikėję išleisti gerokai daugiau nei milijoną dolerių per dieną, kad būtų atlikta penkis kartus daugiau mėginių.)

Amerika turėtų būti puiki vieta tirti genetinę COVID evoliuciją. Jame paplitusios infekcijos, genetiškai įvairi populiacija ir didžiausias paskiepytų asmenų skaičius pasaulyje. Tačiau nepaisant didėjančio genomo sekos nustatymo, kai kurie visuomenės sveikatos ekspertai ir mokslininkai dabar domisi, kas daroma su visa šia informacija ir ar pasiekiami šios srities tikslai.

Savo svetainėje, kurioje aprašoma genomo priežiūra, CDC teigia, kad sekos nustatymas gali atsekti, ar variantai išmoko išvengti vakcinų ar gydymo būdų. Tačiau agentūros stebėjimo sekos programa nesusieja jokios jos sekos su žmonėmis, iš kurių jie atvyko, ar jie buvo paskiepyti, ar susirgo.

Tuo tarpu didžiausias tokio anoniminio stebėjimo sekos argumentas yra tas, kad jis iš anksto įspėja pareigūnus apie galimus atvejų skaičiaus pokyčius. Tačiau reaguodamos į naujienas, kad Amerikoje yra nusistovėję daugiau užkrečiamųjų variantų, valstijos sušvelnino kaukių mandatus ir vėl atidarė maistą patalpose.

Kalbėjomės su daugybe sekvenavimo ekspertų, turinčių tiesioginės patirties pandemijos metu, ir tą patį išgirdome iš daugelio: paverčiant stebėjimo duomenis naudingomis žiniomis, JAV susiduriama su didžiulėmis teisinėmis, politinėmis ir infrastruktūrinėmis kliūtimis, kai kurios iš jų neįveikiamos.

Nebent mokslininkai ir politikos formuotojai paklaus, kodėl jie nori COVID sekų ir kaip geriausiai panaudoti tuos duomenis, genomo stebėjimas duos vis mažėjančios grąžos – ir greičiausiai didžioji jos potencialo dalis bus išeikvota.

Beprotiškai sunku tai padaryti gerai Jungtinėse Valstijose, sako Johnso Hopkinso sveikatos apsaugos centro vyresnysis analitikas Lane'as Warmbrodas. Būčiau labai nusivylęs, jei visi šie pinigai būtų skirti daugybei koronaviruso sekų, o negalvotų apie tai, kas būtų ilgalaikė.

Ko negali padaryti stebėjimo sekos nustatymas

Neabejotina, kad sekos nustatymas buvo revoliucinis visuomenės sveikatai, ypač dėl to, kad mRNR vakcinos buvo sukurtos naudojant sekas, kurios buvo paviešintos praėjus vos mėnesiui po to, kai vyras atsidūrė Uhano ligoninėje su keista liga.

Stebėjimo seka, kuri nustato dalies teigiamų testų genetinį kodą ir ieško pokyčių laikui bėgant, gali padėti tyrėjams sekti viruso evoliuciją. Jei viena padermė didėja greičiau nei kitos, mokslininkai gali ją panaudoti tolesniam tyrimui.

Mūsų stebėjimas yra netobulas, tačiau galime matyti, kada ir kur gauname perdavimą visame regione, ir nustatyti plataus masto pokyčių modelius, sako Duncan MacCannell, Pažangiojo molekulinio aptikimo biuro arba OAMD vyriausiasis mokslo pareigūnas. CDC biuras, atsakingas už nacionalinių sekų nustatymo pastangų išplėtimą.

Į klausimą, kodėl stebėjimo sekos nustatymas yra toks svarbus, valdžios institucijos dažnai atsako, kad tai gali padėti atsekti, kaip padermė elgiasi realiame pasaulyje. Tačiau dažnai tokie argumentai painioja du dalykus: teigiamų testų, kurie buvo anonimizuoti, atranką ir tikslinės analizės naudojimą, kad būtų galima suprasti konkrečius, identifikuojamus atvejus.

The CDC puslapis apie COVID variantų stebėjimo seką Pavyzdžiui, tvirtinama, kad įprastinė genetinės sekos duomenų analizė gali padėti aptikti variantus, galinčius išvengti natūralaus ar vakcinų sukelto imuniteto ir sukelti lengvesnę arba sunkesnę žmonių ligą.

„Tiesiog todėl, kad dažniau matote variantą, ar tai reiškia, kad jis iš tikrųjų yra labiau perduodamas? Gal būt. Turime atlikti daugiau mokslo, kad suprastume, ar tai daro tai, dėl ko mes iš tikrųjų nerimaujame.

Žinodami, kada variantai išmoksta išvengti imuninės sistemos, mokslininkai gali pasakyti, ar jiems reikia keisti vakcinų formules. Tačiau sekos negali pasakyti tų dalykų, nebent jos susijusios su informacija apie žmones, iš kurių jie atvyko. Tai dažnai neįmanoma pagal JAV taisykles.

Vien todėl, kad variantą matote dažniau, ar tai reiškia, kad jis iš tikrųjų labiau perduodamas? Galbūt, sako Brianas Kruegeris, LabCorp, sudariusios COVID sekos nustatymo sutartį su CDC, tyrimų ir plėtros techninis direktorius. Turime atlikti daugiau mokslo, kad suprastume, ar tai daro tai, dėl ko mes iš tikrųjų nerimaujame.

Ši „LabCorp“ sutartis yra pagrindinės OAMD sekos nustatymo programos dalis, pagal kurią mokama didelėms bandymų laboratorijoms visoje šalyje, kad jos nustatytų tūkstančius teigiamų Covid testų. Įgyvendinant projektą visų pirma ieškoma susirūpinimą keliančių variantų, atmainų, kurios jau įtariamos sukelia blogesnes pasekmes arba greičiau plinta. Taip pat stebima, kada ir kur plinta įvairios Covid-19 šeimos medžio šakos ir kurie genetiniai pokyčiai kartojasi. Jei viena viruso šaka auga greičiau nei kitos arba viena mutacija nuolat pasireiškia skirtingose ​​​​šeimose, ji gali būti pažymėta kaip dėmesys.

Tuo pačiu metu OAMD renka neapdorotus mėginius iš visuomenės sveikatos laboratorijų visoje šalyje, kad galėtų atlikti tyrimus laboratorijoje, augindama virusų mėginius induose ir supriešindama juos su vaistiniais preparatais ir pacientų antikūnais. Šie mėgintuvėlių tyrimai yra naujausių antraščių apie vakcinų suteikiamos apsaugos variantus šaltinis. Jie taip pat linkę smarkiai sumažinti imuninę apsaugą nuo ligų, kurios turi daug persidengiančių mechanizmų.

Tačiau dėl pacientų privatumo ir kitų reikalavimų, taikomų reguliavimo priežiūrai, visi šie mėginiai, taip pat visos sekos, kurias jie renka iš laboratorijų, yra sąmoningai atpažįstami: jie neturi ryšio su konkrečiu pacientu.

Žvelgiant į 10 000 pėdų vaizdą

Pasak MacCannell, OAMD neketina kontekstualizuoti savo neidentifikuotų duomenų su klinikine informacija.

Tos sutartys sudarytos taip, kad būtų galima matyti 10 000 pėdų vaizdą, sako MacCannellas.

Net jei ji norėtų savo analizėse derinti stebėjimo sekas su pacientų informacija, agentūra kovotų didžiule kova. JAV dauguma pacientų įrašų – tyrimų rezultatai, imunizacijos informacija, ligoninių įrašai – yra išbarstyti daugelyje nesusietų duomenų bazių. Nepriklausomai nuo to, ar tų duomenų savininkai yra suinteresuoti perduoti informaciją vyriausybei, ar ne, norint ją rinkti, paprastai reikia gauti kiekvieno asmens sutikimą, o tai yra labai sunkus darbas.

Susijusi istorija

Kaip dideliam mokslui nepavyko atskleisti žmogaus smegenų paslapčių

Didelės ir brangios pastangos nustatyti smegenis pradėtos prieš dešimtmetį, tačiau iš esmės nepasisekė. Tai geras priminimas, koks sudėtingas yra šis organas.

Užuot bandę spręsti šias problemas nacionaliniu lygmeniu, sekos sudarymo sutartys leidžia atskiroms visuomenės sveikatos agentūroms prašyti žmonių, kurių testas buvo teigiamas dėl susirūpinimą keliančių variantų, vardų ir kontaktinės informacijos. Tačiau tai tik išstumia tas pačias duomenų nuosavybės problemas.

Kai kurios valstijos yra labai geros ir nori daug sužinoti apie jų valstijoje cirkuliuojančius variantus, sako Brianas Kruegeris iš LabCorp. Kitos valstybės – ne.

Visuomenės sveikatos epidemiologai dažnai turi mažai patirties su bioinformatika ir naudoja programinę įrangą dideliems duomenų rinkiniams, pavyzdžiui, genominėms sekoms, analizuoti. Tik kelios agentūros turi jau egzistuojančias sekos programas; Net jei jie tai padarė, kiekvienai jurisdikcijai išanalizavus tik nedidelę duomenų rinkinio dalį, sumažėja žinių apie elgseną realiame pasaulyje.

Tačiau norint išspręsti šias problemas, kad būtų lengviau sujungti sekas ir klinikinius metaduomenis dideliu mastu, prireiktų daugiau nei tik pagrindinės privatumo taisyklių reformos. Tai reikštų visos JAV sveikatos apsaugos sistemos pertvarkymą, kur kiekviena iš 64 visuomenės sveikatos agentūrų veikia kaip valdos, o informacija ar valdžia nėra centralizuota.

Metaduomenys yra vienintelis didžiausias nesulaužytas riešutas, sako Jonathanas Quickas, Rokfelerio fondo reagavimo į pandemiją, pasirengimo ir prevencijos direktorius. (Rokfelerio fondas padeda finansuoti MIT technologijų apžvalgos aprėptį, nors jis nevykdo redakcinės priežiūros.) Kadangi visuomenės sveikatos ekspertams labai sunku surinkti pakankamai didelius duomenų rinkinius, kad iš tikrųjų suprastų realaus pasaulio variantų elgesį, mūsų supratimas turi kilti iš vakcinų gamintojai ir ligoninės, kurios savo klinikiniams tyrimams prideda seką, sako jis.

Jam apmaudu, kad tiek daug didžiulių naudingos informacijos duomenų rinkinių jau yra elektroniniuose medicininiuose įrašuose, skiepų registruose ir kituose šaltiniuose, tačiau jų negalima lengvai panaudoti.

Yra daug daugiau, ko galima išmokti ir išmokti greičiau, be pančių, kuriuos uždedame dėl tų duomenų naudojimo, sako Quick. Negalime pasikliauti tik vakcinų kompanijomis, kurios atliks priežiūrą.

Valstybės lygio bioinformatikos skatinimas

Jei tikimasi, kad visuomenės sveikatos laboratorijos daugiau dėmesio skirs variantų stebėjimui ir supratimui, joms reikės visos pagalbos. Ką nors daryti dėl variantų kiekvienu konkrečiu atveju yra visuomenės sveikatos darbas, o daryti kažką dėl variantų politikos lygmeniu yra politinis.

Visuomenės sveikatos laboratorijos paprastai naudoja genomiką, kad atskleistų kitaip paslėptą informaciją apie protrūkius arba kaip sekimo ir sekimo pastangų dalį. Anksčiau seka buvo naudojama norint prisijungti E. coli protrūkius konkrečiuose ūkiuose, nustatyti ir nutraukti ŽIV perdavimo grandines, išskirti JAV Ebolos atvejus ir sekti kasmetinius gripo modelius.

Net ir tie, kurie turi nusistovėjusias programas, linkę saikingai naudoti genomiką. Per pastarąjį dešimtmetį sekvenavimo kaina smarkiai sumažėjo , tačiau procesas vis dar nėra pigus, ypač valstybės ir vietos sveikatos departamentams, kuriems trūksta pinigų. Pačios mašinos kainuoja šimtus tūkstančių dolerių, o jų eksploatavimas kainuoja daugiau: „Illumina“, viena didžiausių sekos nustatymo įrangos gamintojų, teigia, kad laboratorijos vidutiniškai išleidžia 1,2 milijono dolerių kasmet kiekvienai savo mašinai.

Praleisime daugybę galimybių, jei tik duosime sveikatos departamentams pinigų programoms parengti neturėdami federalinės strategijos, kad visi žinotų, ką daro.

Sveikatos agentūroms reikia ne tik pinigų; jiems taip pat reikia žinių. Priežiūrai reikalingi aukštos kvalifikacijos bioinformatikai, kurie ilgas sekos raidžių eilutes paverstų naudinga informacija, taip pat žmonės, kurie paaiškintų rezultatus pareigūnams ir įtikintų juos bet kokias išmoktas pamokas paversti politika.

Laimei, OAMD stengėsi padėti valstybės ir vietos sveikatos departamentams, kai jie bando suprasti savo sekos duomenis, samdo regioninius bioinformatikus konsultuotis su visuomenės sveikatos pareigūnais ir palengvina agentūrų pastangas dalytis savo patirtimi.

Taip pat išleidžiami šimtai milijonų kuriant ir remiant pačių tų agentūrų sekos nustatymo programas – ne tik COVID, bet ir visų ligų sukėlėjų atveju.

Tačiau daugelis šių agentūrų susiduria su spaudimu sekti kuo daugiau covid genomų. Neturint nuoseklios duomenų rinkimo ir analizės strategijos, neaišku, kiek šios programos bus naudingos.

Praleisime daugybę galimybių, jei tik duosime sveikatos departamentams pinigų programoms parengti neturėdami federalinės strategijos, kad visi žinotų, ką daro, sako Warmbrodas.

Pirminės vizijos, uzurpuotos

Markas Pandori yra Nevados valstijos visuomenės sveikatos laboratorijos, vienos iš OAMD palaikomų programų, direktorius. Jis daugelį metų buvo stiprus genomo stebėjimo šalininkas. Prieš persikeldamas į Reno, jis vadovavo visuomenės sveikatos laboratorijai Alamedos apygardoje, Kalifornijoje, kur padėjo pradėti programą, naudojančią seką, skirtą stebėti, kaip infekcijos plinta ligoninėse.

Jis sako, kad didžiausias iššūkis visuomenės sveikatos genomikos programoms yra sekų pavertimas naudojamais duomenimis.

CDC gali pasakyti: „Eikite, nusipirkite daugybę sekos nustatymo įrangos, atlikite daugybę sekos nustatymo.“ Tačiau jis nieko nedaro, nebent tų duomenų vartotojai žino, kaip juos naudoti ir žino, kaip juos pritaikyti, sako jis. . Kalbu su jumis apie robotiką, kurios mums reikia, kad dalykai būtų suskirstyti kiekvieną dieną, tačiau sveikatos skyriams tereikia paprasto būdo sužinoti, ar atvejai yra susiję.

Kalbant apie variantus, visuomenės sveikatos laboratorijos patiria tokį patį spaudimą, su kuriuo susiduria CDC: visi nori žinoti, kokie variantai cirkuliuoja, ar jie gali ką nors padaryti su informacija.

Pandori pradėjo savo COVID sekos nustatymo programą, tikėdamasis sumažinti darbo sąnaudas, kurių reikia norint ištirti galimus koronaviruso protrūkius ir greitai nustatyti, ar atvejai, užfiksuoti šalia vienas kito, yra susiję, ar atsitiktiniai.

Jo laboratorija pirmoji Šiaurės Amerikoje identifikavo pacientą, pakartotinai užsikrėtusį COVID-19, o vėliau aptiko B.1.351 variantą ligoninėje gulinčiam vyrui, ką tik grįžusiam iš Pietų Afrikos. Greitai atsekęs kontaktą, sveikatos departamentas sugebėjo užkirsti kelią jo plitimui.

Tačiau apskričių sveikatos departamentai perkėlė savo prioritetus nuo tų pradinių tyrimų, reaguodami į visuomenės dėmesį į žinomų susirūpinimą keliančių variantų stebėjimą, sako jis. Tai žingsnis, į kurį jis žiūri gana skeptiškai.

Mano pradinė vizija naudoti jį kaip epidemiologinį ir ligų tyrimo įrankį buvo uzurpuota naudojant tai kaip varianto nuskaitymą, sako Pandori. Tai tarsi naujas laboratorinių tyrimų etapas. Spėju, kad nuo to, kad neturėjome pakankamai tyrimų, turime nepakankamai genetinės sekos. Štai ką žmonės dabar sako.

(Pandori nėra vienintelis, kurio mokslinių tyrimų interesus nulėmė dėmesys stebėjimui. Kruegeris sukūrė LabCorp COVID sekos nustatymo programą, tikėdamasis ištirti, kaip variantai vystosi atskiruose pacientuose. Panašu, kad šiais laikais valiuta yra, kiek pilnų genomų galite pateikti. į skirtingas duomenų bazes?, sako jis.)

Kiekvieną mėnesį Pandori laboratorija siunčia 40 mėginių į CDC, kaip reikalaujama. Komanda taip pat sekvenuoja 64 savo mėginius per dieną. Kai neturi pakankamai naujausių pavyzdžių, jie pasineria į archyvus; iki šiol jie grįžo į mėginius nuo lapkričio mėnesio.

Kalbant apie 5% Nevados atvejų sekos nustatymą, daugumą tyrimų valstijoje atlieka privačios laboratorijos, kurios paprastai išmeta mėginius prieš juos nustatant. Jis sako, kad egzemplioriai, kurie tiriami privačiose laboratorijose arba antigenų tyrimuose, prarandami stebėjimui.

Pandori sako, kad negirdėjo iš CDC ar visuomenės sveikatos departamento apie CDC laboratorijų programos variantų duomenis.

Darykite tai, nes turite klausimą

JAV gali susidurti su unikaliais sunkumais siedamos variantų sekas su jų elgesiu realiame pasaulyje, tačiau kiekviena sistema susiduria su savais iššūkiais. Netgi šalys, kuriose yra gerai išvystytos nacionalinės sveikatos priežiūros sistemos, stengiasi ginčytis dėl didžiulio duomenų kiekio, kurio prireiks, kad iš tikrųjų suprastų, ką daro šie genetiniai pokyčiai.

Tiesą sakant, yra nedaug vyriausybių, atliekančių šį darbą, ir galbūt tik viena tai sėkmingai atlieka dideliu mastu.

COG-UK, akademinių ir vyriausybinių laboratorijų konsorciumas Didžiojoje Britanijoje, surengė pirmąsias didžiausias pasaulyje koronaviruso sekų nustatymo pastangas ir yra plačiai laikomas spindinčia šios srities žvaigžde. Jos mokslininkai ne tik sekvenavo beveik dvigubai daugiau mėginių nei JAV, bet ir buvo pirmieji, kurie nustatė ir apibūdino variantą su padidintu perdavimu.

Darykite tai, nes turite klausimą. Jei ne, nustokite naudoti visus mūsų Illumina reagentus. Mūsų tiekimo grandinės nukrito nuo tada, kai JAV paskelbė, kad padidins sekos sudarymo pajėgumus.

Pasak konsorciumo mokslinio projekto vadovo Leigh Jackson, jie visa tai padarė už mažiau nei 50 milijonų svarų sterlingų (69 milijonus dolerių). Palyginti mūsų išlaidas su privataus sektoriaus mokesčiais už tokias paslaugas yra gana baisu, sako jis ir pažymi, kad didžioji dalis darbo jėgos atkeliauja iš akademinių laboratorijų, kurios pirmiausia apmokestina medžiagas.

Daugeliu atvejų pagrindinis tikslas yra žinoti apie vakcinų pabėgimo mutacijas realiame pasaulyje. Tai įvyks. Kadangi dabar turime tokią plačią aprėptį ir pajėgumus, turėtume juos gana greitai pamatyti, sako Jacksonas.

Toks darbas įmanomas, nes JK visuomenės sveikata ir medicina yra nacionalizuoti, todėl visi testai ir vakcinų įrašai yra pažymėti unikaliu pacientų NHS numeriu. COG-UK tereikia kelių dalijimosi duomenimis susitarimų, kad visi 400 000 sekvenuotų mėginių būtų susieti su vakcinų sąrašais ir aukščiausio lygio ligoninių duomenimis. Tai nereiškia, kad šiuos duomenų rinkinius lengva sujungti; Grupė šiuo metu kuria supaprastintą sistemą, skirtą sujungti visas kitas atjungtas sistemas, automatizuoti naujų duomenų įkėlimą ir sudaryti sąlygas partneriams lengviau pasiekti.

Jacksonas džiaugiasi girdėdamas apie gerai suplanuotų sekos programų išplėtimą, tačiau jis nesutinka su masiniu sekos nustatymu be aiškiai apibrėžtų tikslų.

Nedarykite to, nes tai yra balsų laimėtojas, gerai atrodo arba daro žmones laimingus. Darykite tai, nes turite klausimą, sako jis. Jei ne, nustokite naudoti visus mūsų Illumina reagentus. Mūsų tiekimo grandinės nukrito nuo tada, kai JAV paskelbė, kad padidins sekos sudarymo pajėgumus.

Nuo pavyzdžio iki „O kas?

Visuomenės sveikatos srityje, skirtingai nei atliekant fundamentinius tyrimus, žinios yra galia tik tada, kai jos ateina su veiksmais. Taip vadina Quick iš Rokfelerio fondo, pereinant nuo imties prie „O kas?“

Kad būtų galima ką nors pasakyti apie vakcinos veiksmingumą, sekos turi būti susietos su imunizacijos duomenimis. Sprendimus priimantys asmenys turi reaguoti į variantus, jei jų seka bus svarbi. (Šiuo metu daugelis JAV valstijų vėl atidaro kino teatrus ir restoranus uždarose patalpose, nepaisant aiškių įrodymų, kad daugiau užkrečiamų padermių sukelia atvejų visoje šalyje.)

Susijusi istorija

Kitas pasiuntinio RNR veiksmas gali būti didesnis nei Covid vakcinos

Naujos pasiuntinio RNR vakcinos, skirtos kovai su koronavirusu, yra pagrįstos technologija, galinčia pakeisti mediciną. Toliau: pjautuvinė ląstelė ir ŽIV.

Warmbrod iš Johns Hopkins tikisi, kad šie pinigai bus naudojami aktyviai, žvelgiant į ateitį, o ne reaktyviai.

Kai grįžtu ir pažiūriu į šešerių, septynerių metų dokumentus, atrodo: „O Dieve, apie šią problemą žinojome daug metų ir nieko nepadarėme“, – sako ji. Kad ir kokius įrankius ir infrastruktūrą kurtume dabar, jie gali būti naudojami daug daugiau nei tik COVID.

MacCannellas mano taip pat: mūsų vaidmuo iš tikrųjų yra išsiaiškinti, kaip išplėsti genomo priežiūrą visoje JAV visuomenės sveikatos sistemoje tokiais būdais, kurie nėra būdingi tik koronavirusui. Norime pasimokyti iš išmoktų dalykų ir plačiai jas taikyti.

Visiems naudinga, jei ši didžiulė pinigų injekcija naudojama ne tik reaguojant į vieną krizę, bet ir ruošiantis kitai. Tai suteikia realią galimybę ištaisyti visuomenės sveikatos sistemos įtrūkimus ir sukurti stabilias institucijas, kurios sumažintų sveikatos skirtumus, stipriai reaguotų į galimas grėsmes ir toliau veiktų krizės metu.

Tuo pačiu metu, jei CDC nori maksimaliai išnaudoti savo, kaip nacionalinės visuomenės sveikatos agentūros, vaidmenį, ji turėtų naudoti visus turimus išteklius, įskaitant šią didžiulę realaus pasaulio variantų sekų saugyklą, kad galėtų stebėti realų pasaulį. elgesys, pavyzdžiui, vengimas vakcinos sukelto imuniteto.

Jei to nepadarysite, tai gali turėti mirtinų pasekmių.

Mes ketiname imunizuoti planetą, ir aš esu labai susirūpinęs, sako Quick. Turime dalytis šiais duomenimis, kad neinvestuotume daug laiko ir pastangų, kad būtų paskiepyta kuo daugiau žmonių, tik sužinotume, kad tai buvo daug mažiau veiksminga, nei manėme. Taip prarandama daugiau gyvybių ir daugiau pasitikėjimo vakcinomis.

Ši istorija yra Pandemijos technologijų projekto, remiamo Rokfelerio fondo, dalis.

paslėpti